
Shinji tem cabelos loiros de queixo comprido e corte reto e muitas de suas expressões faciais revelam os dentes superiores, característica também encontrada em Nnoitra Jiruga. Ele usa um uniforme escolar padrão de Karakura, embora geralmente use um longo casaco cinza, camisa e gravata, e um boné de repórter (embora ele geralmente renuncie ao uso de casaco e boné). Shinji parece ter um anel redondo perfurado no meio da língua. Quando ele era capitão, seu cabelo era muito comprido e descia até a parte inferior das costas. Ele usava o vestido padrão de Shinigami com um haori de capitão padrão no Gotei 13.
Shinji é um tanto cômico, adicionando um pouco de leviandade a situações que de outra forma seriam sérias. Ele tem uma atitude casual em circunstâncias normais e parece gostar de irritar seu associado, Hiyori Sarugaki, o que geralmente resulta em ele levar um tapa em uma de suas sandálias. Ela, por sua vez, não demonstra nenhum respeito por ele e frequentemente o insulta e ataca; embora ele não seja melhor, ele muitas vezes faz caretas ou insultos improvisados às custas dela. Ele também parece ter o hábito de se referir às garotas bonitas que conhece como seu "primeiro amor", com uma cara séria apesar da mentira óbvia (ele aparentemente nunca fez isso com Hiyori, o que o irrita ainda mais). Ele também parece gostar de ouvir jazz, pois tinha um fonógrafo que tocava seus discos de vinil durante sua capitania. Apesar disso ele é bastante perspicaz quando se trata de outras pessoas e durante seu tempo como capitão ele foi uma das poucas pessoas que parecia desconfiar de seu então tenente Aizen, e aparentemente podia sentir ou ver através de algumas de suas ilusões. Ele também percebe rapidamente certos aspectos doUrahara. Aizen até admitiu estar um tanto intimidado por ele. Quando irritado ou em batalha, Shinji é bastante calmo, sério e equilibrado. Durante uma conversa com Ukitake, ficou implícito que ele era capitão de longa data. No entanto, ele não está incluído na lista de capitães de Shunsui Kyōraku de 100 anos atrás (agora há 200 anos, como foi dito durante o Arco do Pêndulo).

Deve-se lembrar que é Shinji pelo menos 100 anos após a Batalha de Fake Karakura".
Há cerca de 210 anos, Shinji, como capitão da 5ª Divisão, se prepara para participar de uma cerimônia de promoção de capitão e cumprimenta a chegada de seu tenente Sōsuke Aizen. À medida que o grupo se move para dentro, Shinji pergunta a Love como está o número de funcionários para a cerimônia, ao que Love responde que quase todo mundo já está lá. Shinji afirma que vê que ninguém da 11ª divisão apareceu. O amor explica para ele que é o jeito dele, porque ele faz o que quer. Shinji diz que não é porque ele é o 10º"Kenpachi"que ninguém tem coragem de controlá-lo. Ele continua dizendo que não consegue entender por que deixaram um gostoso como ele se tornar capitão.
Love tenta tranquilizá-lo explicando que não adianta ficar chateado, porque o "Kenpachi"Chosen sempre ocupou o cargo de capitão da 11ª divisão. É uma espécie de legado e não vai mudar tão cedo. Love continua dizendo que se Shinji quer reclamar de alguma coisa, ele deveria reclamar que a incompetência do anterior Kenpachi tornou isso possível. A conversa dos dois capitães é interrompida pela chegada do capitão da 8ª divisão Shunsui Kyōraku acompanhado por sua tenente Lisa Yadōmaru e pelo capitão da 13ª divisão Jushiro Ukitake. Shunsui acusa os dois de fofocar pelas costas dos outros. Shinji então testemunha a conversa entre Shunsui e Ukitake sobre quem foi capitão por mais tempo e o que aconteceu com o capitão anterior da 12ª Divisão, Kirio Hikifune. Ele ressalta que eles passam pelo capitão mais rápido que o papel higiênico. Vemos então Shinji esperando na fila com os outros capitães enquanto o novo capitão da 12ª divisão, Kisuke Urahara, chega na reunião. Ele está visivelmente impressionado com o comportamento e a primeira impressão queUrahara feito durante sua cerimônia de promoção.

Nove anos depois, Shinji e Aizen estão andando na Seireitei quando encontram Urahara, Hiyori e Mayuri Kurotsuchi, o terceiro assento. Enquanto Shinji entra em uma briga infantil e discute com Hiyori novamente, Aizen peça para Urahara se ele ouviu a notícia, para a qual Urahara diz a ele que não. Shinji pega a história e conta Urahara a série de mortes estranhas que ocorreram em Rukongai. Shinji também informa que a 9ª Divisão foi enviada para cuidar da investigação. Mais tarde naquela noite, Shinji é enviado com Love Aikawa, Rōjūrō Otoribashi, Hachigen Ushōda e Lisa Yadōmaru para investigar o desaparecimento do povo de Rukongai e do capitão Kensei Muguruma e membros de sua divisão pelo capitão-comandante Genryūsai Shigekuni Yamamoto. Ao chegar ao local da investigação, Shinji impede o que parece ser um Kensei oco de atacar Hiyori, que foi enviado para lá para coletar amostras a pedido da 9ª Divisão.
Com a chegada do resto da equipe de investigação eles se perguntam se a criatura é realmente Kensei Shinji afirmando que ele não sabe se é Kensei, mas que se eles não desembainharem as espadas, estarão praticamente mortos. Depois que Kensei soltou um grito alto, Shinji pega Hiyori e dá um passo para trás, então ele observa enquanto Love se envolve na batalha com Kensei. Quando Hiyori implora para que parem de brigar porque seu Kensei começa a tossir. Shinji diz a ele para calar a boca porque eles têm que impedi-lo, especialmente se for Kensei. Quando Mashiro Kuna aparece atrás de Rose e a ataca Shinji a chama para que sua atenção seja direcionada para ele. Mashiro caminha em direção Shinji e a ataca, mas ele a bloqueia. Ele é auxiliado pela chegada oportuna de Hachi, que usa Bakudō #75. “Gochūtekkan” para dominá-lo. Hachi comenta, oh, quão rápido os outros estão chegando. Hachi percebe que Love está tendo problemas para lutar contra um Kensei Hollowfied e usa Bakudō #63. “Sajo Sabaku” para dominá-lo também. Ele então pergunta Shinji o que está acontecendo e o que aconteceu com Mashiro e Kensei, mas eles são interrompidos pela libertação de Kensei.
De repente, Hiyori começa a tossir incontrolavelmente. Shinji pergunta se ela está bem e diz a Hachi para começar com ela, mas é interrompido quando Hiyori engasga e ela quer que ele a deixe ir. Hiyori então cava e ataca Shinji com um corte no peito, para desespero de todos. É então que a escuridão envolve a equipe de resgate e eles são atacados por um agressor invisível. Shinji é o único que está consciente, e quando a escuridão passa, ele vê que o atacante é Kaname Tōsen, o 5º Assento de Muguruma. Shinji pergunta como ele poderia trair seu capitão, é então que a atenção de Shinji é atraído pela chegada deAizen e de Gin Ichimaru.

Aizen explica-lhe que não traiu ninguém e que é muito leal e apenas seguiu fielmente as suas ordens. Shinji admite que não está tão surpreso quanto deixa transparecer e Aizen pergunta se ele suspeitava e declara que esperava muito de seu capitão. Shinji então explica que sabia que algo era perigoso Aizen e que ele não era confiável. É por estas razões que Shinji o escolheu para ser seu tenente e assim ele poderia ficar de olho nele. Aizen diz-lhe que lhe é grato, pois devido às suas profundas dúvidas não suspeitou de nada. Quando Shinji afirma que já fez saber que tem suspeitas, Aizen ressalta que ele não percebeu que todo o último mês não foi Aizen que andava atrás dele.
Aizen continua explicando o poder de sua Zanpakutō, Kyōka Suigetsu. Aizen informa Shinji como se ele estivesse tão pertoAizen que outros capitães são seus tenentes, ele poderia ter visto claramente em seu jogo ao descobrir as diferenças sutis entre Aizen e o homem que desempenha o papel de sósiaAizen. Foi a sua falta de confiança que os impediu de se aproximarem e permitiu Aizen enganar Shinji. Ele também explica que sempre poderia ter se recusado a ser tenente da Shinji, mas que ele decidiu não fazê-lo porque a natureza suspeita de Shinji tornou a posição ideal para executar seus planos. Aizen rejeita, portanto, a responsabilidade pela situação actual da Shinji e seus companheiros aos pés de Shinji, o que é causado por esta situação que desencadeia uma aceleração do processo de Hollowficação. Aizen agradece por ser tão facilmente provocado e observa a conexão observada entre Hollowfication e emoções agitadas.
No dia seguinte, Urahara e Tessai são presos sob as ordens das 46 câmaras centrais. O Shinigami Hollowfied são condenados a serem executados como Hollows. No entanto, antes que qualquer uma das suas sentenças possa ser executada, ambos são salvos por Yoruichi Shihōin, que os leva para uma área subterrânea secreta. Na área secreta, ela também trouxe Hachi e os outros Shinigami Hollow, assim como o protótipo do novo Gigai que estava sendo trabalhado Urahara. Com esta revelação, Urahara decidiu fazer dez Gigai bloqueadores de Reiatsu para ajudar ele, Tssais e as oito vítimas a escapar para o mundo real, onde encontrariam uma maneira de desfazer o processo de Hollowfication.
Quando Ichigo finalmente decide aparecer no armazém da Vizard, Shinji admite que está surpreso com a forma como Ichigo foi capaz de encontrá-los, já que ele é muito ruim em sentir pressão espiritual, ele então admite que eles deliberadamente deixaram sua reiatsu vazar para tornar as coisas mais fáceis para ele. Ichigo então diz a ele que não tem intenção de se juntar a eles, ele só veio para "usá-los" para ajudá-lo a controlar seu Hollow interior. Shinji pergunta como ele planeja fazer isso e Ichigo responde com força quando ele deixa seu corpo e ataca Shinji que rebate seu ataque e os dois começam a lutar.
Finalmente, Hiyori ataca Shinji deixando-o cair e enviando-o através de uma parede próxima. Hiyori então explica para Ichigo como a situação se desenrolará enquanto ela se prepara para enfrentá-la. Ele testemunha o vazio interior deIchigo que quase sufoca Hiyori, e ele, assim como o outro Vizard, rapidamente restringe Ichigo antes que ele possa matá-la. Shinji então usa a ponta de sua Zanpakutō para quebrar o que resta da Máscara Oca deIchigo, afirmando que o exemplo do poder daIchigo foi o suficiente, ele então pergunta a Hiyori se ela tem alguma reclamação, embora ela esteja com muito medo de responder. Shinji então disse para Ichigo que o vazio interior de uma pessoa não é algo que possa ser subjugado pela mente, pelo corpo ou por um simples pensamento. Mas ele garante Ichigo que, desde que ele passou no teste, eles irão penetrar profundamente em sua alma a “técnica de supressão oca”.
Mais tarde, Shinji acompanha o outro Vizard até sua área de treinamento subterrânea. Shinji então diz a Hachi para colocar uma barreira lá também. Hachi está visivelmente confuso e Shinji não seja estúpido, porque não há nada de fofo em um velho dizer "Ehhhh". Shinji também o faz amarrar as pernas e os braços, ao qual Hachi se refere em Bakudō #75. “Gochūtekkan.” É um testemunho da transformaçãoIchigo em um Hollow, avisando aos outros que ele veio. Depois que Hachi ergueu uma barreira ao redorIchigo e que Lisa Yadōmaru foi lutar com ele. Shinji diz a ele para não matar Ichigo e ela diz a ele que isso pressupõe que ele não a mate primeiro. Pouco depois de sua luta, Lisa pergunta Shinji quanto tempo de intervalo eles têm, ele responde que como são oito no total no rodízio, dez minutos multiplicados por oito pessoas equivaleriam a oitenta minutos. Mas ele rapidamente é corrigido por Hiyori e se corrige dizendo que seriam setenta minutos.
Finalmente, a forma oca deIchigo começa a quebrar. Shinji observar quando Ichigo conquista seu Hollow interior e assume o controle de seu corpo. Shinji pede a Hachi para quebrar a barreira para que ele possa falar com ele quando Ichigo desaparece. Shinji pergunta como ele se sente, o que Ichigo responde que não se sente tão mal. Quando a Espada chega ao mundo dos vivos, Ichigo sente a presença de Grimmjow Jaegerjaquez e corre para lutar com ele. Ele é contido por Kensei Muguruma e Love Aikawa, mas Shinji diz a eles para deixá-lo ir. Shinji mais tarde o persegue e salva Ichigo e Rukia Kuchiki do ataque de Cero depois Grimmjow derrotou os dois.
Ele comenta que odeia se envolver em brigas Shinigami, mas admite que quando ouvimos o som de combates tão próximos, não podemos ignorá-lo. Quando Grimmjow pergunta quem ele é, Shinji diz a ele que isso não importa e Grimmjow o ataque. Conversando um pouco com Grimmjow, ele é repentinamente atacado pelo Espada, que declara sua intenção de matá-lo. Evitando todos os ataques, Shinji percebe o quanto Grimmjow é violento e a luta destrói tudo ao seu redor. Assim, Shinji coloca sua máscara oca sob o choque de Grimmjow enquanto Shinji enfrenta o Espada. Shinji disse para Grimmjow que ele sente muito, mas parece forte, enquanto se prepara para disparar um Cero no Espada. A explosão envia Grimmjow correndo em direção à cidade abaixo. Shinji então diz a ele que sabe que o Espada minimizou os danos do Cero ao acertá-lo com os seus próprios. Um Grimmjow enfurecido tira sua Zanpakutō e começa a se libertar, mas Ulquiorra Cifer venha e colete Grimmjow antes que ele possa fazer isso.
Shinji e o resto do Vizard chegam à cidade falsa de Karakura, assim como Aizen e sua força começa a tomar conta e o confronta com seu sorriso habitual. Shinji pergunta a seu companheiro de equipe Vizard se há alguém no Gotei 13 com quem ele gostaria de conversar e acaba discutindo brevemente com Hiyori, seguido pelo resto de seus companheiros que expressam seu desinteresse em conversar com seus ex-companheiros (com exceção de Lisa, que rapidamente se afasta para ver o capitão Shunsui Kyoraku). Enquanto o resto do Vizard se envolve na batalha contra o Menos Grande, Shinji confrontar Aizen cara a cara e diz a ele que "é hora de acabar com isso", enquanto ele remove parcialmente a máscara, ele ataca Sōsuke Aizen.
Infelizmente, seu ataque é bloqueado por Kaname Tōsen, que consegue fazer um pequeno corte acima do olho esquerdo. Quando estava prestes a receber outro ataque de Tōsen, Sajin Komamura interveio na batalha, dizendo que havia decidido ajudar o Vizard e que "ele não aceitaria um não como resposta". Enquanto o Gotei 13 e o Vizard luta contra o Espada, Shinji está empenhado numa luta contra Gin, que é interrompido abruptamente apósAizen atacou Harribel e cancelou o Gin e Tosen.
hinji aparece perto de Hiyori e diz a ela e aos outros que seria melhor não se aproximarem muito rapidamenteAizen, explicando que com a capacidade deAizen, estaríamos acabados antes que isso começasse se eles não tivessem um plano em mente. Hiyori diz a ele que eles sabem muito, mas Shinji diz a ela que ele está falando especificamente com ela, enquanto diz a ela para recuar. Aizen começa a insultá-los afirmando que não importa o que façam, o final será sempre o mesmo, pois seu destino já foi decidido. Shinji diz a Hiyori para não ouvir, pois ele está apenas tentando provocá-la. Aizen prossegue afirmando que eles não têm mais nada a temer desde que todos morreram naquela noite, há mais de 200 anos.
Essa provocação deixa Hiyori no limite, enfurecida, ela se dirige para Aizen para atacá-lo, enquanto Shinji grita para ele parar. Antes que ela perceba, Hiyori é cortada ao meio na cintura pelo Shikai de Gin Ichimaru. Shinji grita com Hiyori e imediatamente a agarra quando a metade superior de sua cintura cai. Hiyori, agora mortalmente ferida, conta Shinji que ela está arrependida porque não conseguiu se controlar. Shinji chama Hachi, mas quando ele percebe que só tem um braço, ele imediatamente se lembra disso.Orihime Inoue tem habilidades de cura enquanto grita por Ichigo.
Shinji comenta queAizen desembainhou sua lâmina, ficando um tanto surpreso com o que ele fez. Ele então pergunta Aizen se ele está com medo, mas Aizen fique em silêncio. Shinji em seguida, afirma que não adianta ignorá-lo, pois por mais forte que ele seja, ele deve estar sempre desconfortável. Ele então citaAizen, há 100 anos, sobre o facto de Shinji nunca se abriu com ele, nunca disse nada para ele e nem tentou conhecê-lo. Ele então disse para Aizen que por causa disso, ele não tem ideia dos poderes que sua Zanpakutō possui. Shinji declara para Aizen que se ele pensava que sua Kyōka Suigetsu era a única Zanpakutō que poderia controlar absolutamente os sentidos dos outros, ele estava completamente errado. Ele então libera seu Zanpakutō, Sakanade.
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A história começa com a aparição repentina da shinigami Rukia Kuchiki no quarto de Ichigo Kurosaki.
Ela fica surpreendida com a capacidade deste último de a ver, mas a conversa é rapidamente interrompida pela aparição de um "Hollow", um espírito maléfico. Depois de Rukia ter ficado gravemente ferida ao tentar proteger Ichigo, ela tenta transferir metade dos seus poderes para Ichigo para que ele possa enfrentar o Hollow em pé de igualdade. Em vez disso, Ichigo absorve involuntariamente quase toda a sua energia, o que lhe permite derrotar o Hollow com facilidade. No dia seguinte, Rukia aparece na turma de Ichigo sob a forma de uma Humana aparentemente normal, e informa Ichigo de que a absorção dos seus poderes a deixou retida no Mundo Humano até recuperar as suas forças. Entretanto, Ichigo acolhe Rukia em sua casa e retoma o trabalho de Shinigami, combatendo os Hollows e guiando as almas perdidas até à Soul Society.
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